哪位皇帝在位是郑成功的后代归顺清朝
郑成功后代归顺清朝，当时在位的皇帝是康熙皇帝（爱新觉罗・玄烨）
领军攻台
1683年（康熙二十二年）六月十四日，施琅督率水军由铜山出发。在进攻路线的选择上，施琅根据风向和敌方防御情况的情报，决定清军船队从铜山（今福建东山岛）启航，乘六月的西南季风向东穿越台湾海峡，首先夺取地处澎湖主岛以南、郑军防守薄弱的八罩岛。这样就可获得船队的锚泊地和进攻出发地，占据上风上流的有利位置向澎湖发起攻击。攻下澎湖，扼敌咽喉，然后兵锋直指台湾，可顺利实施“因剿寓抚”的战略方针
六月十六日，清军舰队向澎湖郑军发动第一次进攻，初战失利。施琅很快吸取教训，对下一步作战行动进行了周密筹划和部署。施琅将清军分为四部分：施琅亲率56只大型战船组成的主攻部队，正面进攻郑军主阵地娘妈宫；总兵陈蟒等率领由50只战船组成的东线攻击部队，从澎湖港口东侧突入鸡笼屿，作为奇兵，配合主攻部队夹击娘妈宫；总兵董义等统率另50只战船组成的西线攻击部队，从港口西侧进入牛心湾，进行佯动登陆，牵制西面的郑军；其余80只战船作为预备队，随主攻部队跟进。十八日，施琅先派战船攻取澎湖港外的虎井、桶盘二岛，扫清了外围。二十二日早七时，经过充分休整和准备的清军向澎湖郑军发起总攻。经过9小时激战，清军取得全面胜利，共毙伤郑军官兵1.2万人，俘获5000余人。击毁、缴获郑军战船190余艘。郑军主将刘国轩乘小船从北面的吼门逃往台湾。此役清军阵亡329人，负伤1800余人。
招抚郑氏
此后，施琅又一面加紧军事行动，一面对占据台湾的郑氏集团施以招抚。在施琅大军压境之下，郑克u茫然地说：“现在台湾人心风声鹤唳，继续守卫台湾恐怕右边啊；士卒满目疮痍，再战下去恐怕难以取胜。还是应当请降，以免今后追悔莫及。”郑克u听从了刘国轩的劝告。
八月十三日，施琅率领舟师到达台湾，刘国轩等带领文武官员军前往迎接。施琅入台之后，主动前去祭郑成功之庙，对郑氏父子经营台湾的功绩作了高度的评价，并称郑氏收复台湾是为国为民尽职的举动，对郑成功毫无怨仇。祭祀完成之后，施琅哽不成声，热泪纵横。郑氏官兵和台湾百姓深受感动。赞扬施琅胸襟宽广，能以大局为重。冷静处理公义私怨的关系，远非春秋时期的伍子胥所能比拟。
当时，清廷内部对台湾地位的重要性认识不足，对是否留台存在争议。施琅上疏力主留台卫台。在分管兵部的清朝东阁大学士（宰相）潘湖叟黄锡衮的支持下，施琅（乃分管兵部的内阁大臣潘湖叟黄锡衮的妹夫）的意见打动了康熙帝和朝中大臣，清廷终于决定在台湾设府县管理，屯兵戍守。[
郑成功（闽南语：Tenn Sing-Kong；1624年8月27日－1662年6月23日），名讳郑森（闽南语：Tēnn Sim），表字明俨、大木，幼名福松，为东宁王朝的开国君王。郑成功原为中国南明政权的大将军，因蒙南明绍宗赐明朝国姓朱，赐名成功，世称“国姓爷”、“郑赐姓”、“郑国姓”、“朱成功”，又因蒙南明昭宗封延平王，称“郑延平”。尊称“延平郡王”、“开台尊王”、“开台圣王”等。1645年清军攻入江南，不久芝龙降清、田川氏在乱军中自尽；郑乃率领父亲旧部在中国东南沿海抗清，成为南明后期主要军事力量之一，一度由海路突袭、包围清江宁府（原明朝南京），但终遭清军击退，只能凭借海战优势固守海岛厦门、金门。1661年率军横渡台湾海峡，翌年击败荷兰东印度公司在台湾大员（今台湾台南市境内）的驻军，开启郑氏在台湾的统治，但不久即病死。郑成功死后，台湾民间陆续建立庙宇祭祀，其中以台南延平郡王祠最为重要。
康熙
郑成功有十个儿子。
郑经，郑成功长子，字符之，号式天，乳名锦。继承父亲延平郡王、招讨大将军之官爵；在英国东印度公司的纪录中被称为“台湾国王”。
郑聪，郑成功次子，字哲顺，号怡堂。康熙二十二年，授三品之职。
郑明，郑成功三子，字哲熙，号熙之。康熙二十二年，授四品之职。
郑睿，郑成功四子，字哲圣，号圣之。被清兵淹死。
郑智，郑成功五子，字哲锡，号锡之。康熙二十二年，授四品之职。
郑宽，郑成功六子，字哲硕，号硕之。不知所终。
郑裕，郑成功七子，字哲益，号益之。康熙二十二年，授四品之职。
郑温，郑成功八子，字哲念，号念斋。康熙二十二年，授四品之职。一说，被清兵淹死。
郑柔，郑成功九子，字哲能，号能之。康熙二十二年，授四品之职。
郑发，郑成功十子，字哲奋，号奋之。被清兵淹死。
即使是最后投降的郑克爽，也没有被杀，而是被软禁终身，其子孙后代，虽然待遇不怎么好，但据说当代还有人找到过郑克爽的直系后裔。
台湾知名鱼类学家郑守让（原名郑明能）是郑成功第六子郑宽的后代，为郑成功九世孙。
诗人郑愁予（原名郑文韬）乃郑成功第十五代裔孙。
没有灭门的关键在于：
1、灭门是一种惩戒行为，而康熙时代政局已经稳定，不必再用屠杀的方式灭门。更何况郑克爽是主动投降的，如果主动投降都会被灭门，以后没人敢投降了。
2、郑成功在福建台湾甚至浙江一带都还颇得老百姓怀念。他赶走荷兰人这一点也是清政府需要肯定的。如果贸然灭门，会失去民心。
3、郑成功的后代已经对清朝构不成具体的威胁了，给一些名誉职位安抚即可。
康熙皇帝吧。郑成功孙子郑克u归顺
1683年，清朝政府派郑成功前部下施琅率领清军，终于击溃了郑克u，郑克u于七月十五日（新历9月5日）向施琅投降，并于八月十八日（10月8日）剃发易服，“台湾有史以来首次正式被收编为中国的一部分”
郑克u（1670年8月13日―1707年9月22日 ），幼名秦，人称秦舍，字实弘，号晦堂，郑经次子，郑成功之孙。康熙二十年（1681年）郑经及陈永华相继去世，重臣冯锡范联合郑经从弟等人发动政变，刺杀监国郑克臧得逞，立年仅十二岁的郑克u为延平郡王。
康熙二十二年（1683年），清朝水师提督施琅于澎湖海战大破郑军舰队，攻占澎湖，郑军主将刘国轩逃回台湾。冯锡范遂劝说郑克u降清。七月初五，冯锡范命郑德潇写降表。七月十五日，冯锡范将郑克u送交施琅。八月十三日，施琅进入台湾受降。随后郑克u前往京师，隶属汉军正红旗，受封为嘉德官。康熙四十六年（1707年），郑克u病故，爵位无袭。
是康熙皇帝。
1680年（康熙十九年）正月，清福建水师提督万正色率舟师进攻金、厦。郑经以右武卫林陛督师抵御，刘国轩部亦自海澄来援，战皆不利，郑经率诸将回台湾。其母董夫人见而责之曰：“七府连败，二岛亦丧，皆由汝无权略果断，不能任人，致左右窃权，各树其党。”郑经无言以对。秋八月，清贝子赖塔复致书郑经，准照朝鲜事例，“不剃发，不登岸，称臣入贡，俾沿海生灵永息涂炭”。郑经复书，请如约，请要求留海澄为互市地。福建总督姚启圣不许，和议又再次搁置。郑经于台南建造园亭“北园别馆”，为其在台湾的行馆以及安养母亲董氏之所，1960年改建为“海会寺”，亦名台南开元寺，至今已有将近三百年的历史，历经几次修建，在建筑风格上保有‘伽蓝格局’，为典型佛寺的形制，为国家二级古迹。